La nueva evidencia viene del estudio del DNA mitocondrial de estos restos. Este fue realizado por Svante Pääbo de la Universidad de Munich y Mark Stonekin de la Universidad del Estado de Pennsylvania, que hicieron el análisis por separado, coincidiendo completamente. Ambos investigadores encontraron que en el DNA mitocondrial de este esqueleto de las 328 posiciones estudiadas de la secuencia de las bases del DNA, 27 eran diferentes, comparados con el promedio del hombre moderno (Cell, vol. 90, pág. 19,1997) Pääbo dice que para este hallazgo no tienen otra interpretación, sino que el hombre de Neanderthal no es el ancestro del hombre moderno europeo. Para estar seguro habría que examinar también otros esqueletos Neanderthal que han sido encontrados en otras partes de Europa.

De confirmarse estos hallazgos, significaría que el hombre moderno se habría separado de un ancestro común, hace por lo menos 600.000 años. Ello se puede calcular por el número de mutaciones del DNA mitocondrial (ver recuadro).

Estos resultados apoyan la idea de que el primer hombre (Homo) apareció realmente en África hace más o menos 150.000 años y que desde allí emigró a Europa y el resto del mundo (Los antepasados de la especie humana). De este modo el hombre de Neanderthal correspondería a una especie diferente, ya que estaría distante de todas las razas de homo conocidas. En el cuadro 1, de acuerdo a estos resultados, se esquematiza el nuevo árbol genealógico, acomodándose a que las dos razas se habrían separado hace aproximadamente 600.000 años.

Lo probable entonces es que el Homo proveniente de África, más evolucionado, al llegar a Europa no se mezcló con el Neanderthal, sino que desplazó esta forma arcaica. Se deja a la imaginación interpretar lo que allí sucedió, cuando estas dos especies se encontraron en esos muy lejanos tiempos.